Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFX1Q12986 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFX1Q12986 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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