Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2AQ12879 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2AQ12879 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
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