Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STX4Q12846 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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