Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSRP1Q08945 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms