Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGM3Q08188 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms