Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBQ06643 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBQ06643 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBQ06643 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBQ06643 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBQ06643 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBQ06643 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms