Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms