Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms