Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EMX2Q04743 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156 ms