Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OC90Q02509 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OC90Q02509 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OC90Q02509 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OC90Q02509 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OC90Q02509 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OC90Q02509 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OC90Q02509 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OC90Q02509 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OC90Q02509 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OC90Q02509 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OC90Q02509 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OC90Q02509 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OC90Q02509 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OC90Q02509 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OC90Q02509 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OC90Q02509 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OC90Q02509 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OC90Q02509 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OC90Q02509 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OC90Q02509 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OC90Q02509 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OC90Q02509 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OC90Q02509 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OC90Q02509 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OC90Q02509 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OC90Q02509 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OC90Q02509 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms