Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OTUD4Q01804 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms