Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLTCQ00610 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms