Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK16Q00536 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms