Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK5Q00535 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms