Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HERVK_113P63121 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms