Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS4XP62701 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS4XP62701 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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