Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXW4P57775 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms