Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX16P57768 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX16P57768 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms