Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIRAP54198 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIRAP54198 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIRAP54198 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIRAP54198 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIRAP54198 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIRAP54198 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIRAP54198 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms