Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRE11P49959 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRE11P49959 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRE11P49959 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRE11P49959 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRE11P49959 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms