Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF6P49848 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF6P49848 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF6P49848 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF6P49848 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF6P49848 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF6P49848 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF6P49848 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF6P49848 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF6P49848 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF6P49848 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF6P49848 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF6P49848 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms