Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCT3P49368 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCT3P49368 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCT3P49368 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCT3P49368 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCT3P49368 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCT3P49368 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCT3P49368 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCT3P49368 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT3P49368 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT3P49368 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT3P49368 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT3P49368 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT3P49368 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT3P49368 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT3P49368 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT3P49368 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCT3P49368 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms