Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POU3F4P49335 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms