Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRATP43155 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRATP43155 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRATP43155 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRATP43155 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRATP43155 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRATP43155 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRATP43155 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRATP43155 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRATP43155 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRATP43155 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms