Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTGDSP41222 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms