Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDH1P40925 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDH1P40925 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDH1P40925 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDH1P40925 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDH1P40925 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDH1P40925 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDH1P40925 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MDH1P40925 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MDH1P40925 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MDH1P40925 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDH1P40925 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDH1P40925 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDH1P40925 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDH1P40925 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDH1P40925 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDH1P40925 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDH1P40925 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MDH1P40925 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MDH1P40925 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms