Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1BP36896 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1BP36896 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms