Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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HOXD13P35453 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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HOXD13P35453 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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HOXD13P35453 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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HOXD13P35453 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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HOXD13P35453 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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HOXD13P35453 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD13P35453 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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