Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB2P29033 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB2P29033 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJB2P29033 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJB2P29033 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJB2P29033 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJB2P29033 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJB2P29033 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJB2P29033 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJB2P29033 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB2P29033 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms