Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD10P28358 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms