Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB4P28070 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB4P28070 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms