Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IL3RAP26951 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms