Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GCSHP23434 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
GCSHP23434 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
GCSHP23434 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
GCSHP23434 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
GCSHP23434 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
GCSHP23434 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms