Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT1P21579 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT1P21579 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT1P21579 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT1P21579 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT1P21579 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT1P21579 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT1P21579 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT1P21579 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT1P21579 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT1P21579 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT1P21579 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT1P21579 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT1P21579 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT1P21579 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT1P21579 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT1P21579 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms