Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms