Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD46P15529 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD46P15529 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD46P15529 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD46P15529 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD46P15529 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD46P15529 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD46P15529 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD46P15529 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD46P15529 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CD46P15529 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD46P15529 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms