Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA4P13612 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA4P13612 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms