Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NGFRP08138 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NGFRP08138 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NGFRP08138 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NGFRP08138 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NGFRP08138 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms