Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEFLP07196 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEFLP07196 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEFLP07196 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEFLP07196 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEFLP07196 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEFLP07196 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEFLP07196 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEFLP07196 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEFLP07196 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms