Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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