Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVILO95425 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVILO95425 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVILO95425 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVILO95425 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms