Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK1O94907 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK1O94907 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK1O94907 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK1O94907 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK1O94907 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK1O94907 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK1O94907 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK1O94907 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK1O94907 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK1O94907 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK1O94907 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK1O94907 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK1O94907 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK1O94907 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK1O94907 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK1O94907 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK1O94907 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK1O94907 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK1O94907 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK1O94907 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK1O94907 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK1O94907 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK1O94907 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK1O94907 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK1O94907 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK1O94907 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DKK1O94907 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK1O94907 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK1O94907 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK1O94907 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK1O94907 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK1O94907 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK1O94907 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK1O94907 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK1O94907 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK1O94907 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK1O94907 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK1O94907 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK1O94907 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms