Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL18O94889 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms