Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RGPD8O14715 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGPD8O14715 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms