Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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