Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms