Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms