Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM5B3KS81 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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