Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LINC00587B1AMM8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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LINC00587B1AMM8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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LINC00587B1AMM8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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LINC00587B1AMM8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LINC00587B1AMM8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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