Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC160A6NGH7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms